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基于肽序列标签的蛋白质翻译后修饰中的过滤算法
李文军 徐云 邵明芝
计算机应用
2012, 32 (05):
1488-1490.
大量的质谱数据无法被鉴定或是鉴定的精度不够高，特别是在肽段数据库较大时，普通的算法精度下降很快。提出一种新的盲搜索算法，此算法基于一种全新的基于相似关系度量的打分模型。为了处理大规模问题，同时还应用了基于母离子质量和肽序列标签的前过滤方法，使得此算法在较大规模的数据库上精度得到很好的保证。实验结果表明，对于规模为10000, 20000, 50000的肽段数据库，其鉴定准确率分别为78.3%，74.2%，65.5%。随着数据库规模的增大，算法的鉴定准确率保持得较好。
参考文献 |
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